2.1. La bouche

La bouche est le premier orifice de l'appareil digestif, c'est l'ensemble de la cavité orale. Les glandes salivaires y déversent leur produit de sécrétion.

Les dents sont ensuite les premières choses que rencontrent les aliments.

2.2. La dentition

Les dents permettent au rat de casser les aliments en plus petits morceaux. On distingue des incisives qui lui permettent de ronger et des molaires qui lui permettent de broyer.

Ceux-ci vont ensuite plus facilement avoir e contact avec la salive.

2.3. Les glandes salivaires 

Elles humidifient l'aliment pour favoriser sa mastication et le lubrifient pour favoriser sa déglutition.

Une fois les aliments bien humidifier, ils vont être avalé et passer dans l’oesophage.

2.4. L'oesophage 

Il achemine l'aliment, depuis la bouche où il a subi l'action des dents et l'imprégnation de la salive, jusqu'à l'estomac grâce à la déglutition (contraction des muscle de l’oesophagiens).

2.5. L'estomac

Ce dernier est divisé en deux parties; la région distale glandulaire et la région proximale (sans glandes digestives). Le rat fait de petits repas répétés, ainsi l'estomac a une faible capacité. La sécrétion acide de l'estomac est continue.
Rem : la population bactérienne de ce compartiment a pour vocation de digérer la cellulose des végétaux.

Une fois les aliments décomposés en plus petite partie par l’estomac, ceux-ci vont passer dans l’intestin grêle.

2.6. L'intestin grêle

L'intestin grêle est le site majeur de l'absorption des produits issus de la digestion tandis que le rectum constitue le conduit excréteur des déchets : les fèces.